Provavelmente a história não seria essencialmente diferente. A guerra não aconteceu por causa da perseguição aos judeus, mas por um projeto expansionista, autoritário e militarista.
Acho que a história teria tomado rumos diferentes. A perseguição sistemática aos judeus/a implementação do Holocausto foram elementos centrais da ideologia nazista e moldaram tanto a política interna quanto a percepção internacional do regime. Sem essa política genocida, o regime poderia ter mantido maior foco em objetivos militares e expansionistas, possivelmente obtendo mais apoio interno, já que parte da população alemã não necessariamente apoiava a violência extrema contra minorias, mas sim o discurso nacionalista e a promessa de recuperação econômica. Mas a guerra ainda teria sido devastadora, porque a ambição territorial do Hitler e sua visão de dominação europeia não dependiam só da perseguição aos judeus...
Ainda seria um regime totalitário e expansionista com foco em guerras e nacionalismo extremo. Ainda seria terrível e ainda teria guerra, mas talvez a gente não teria a imagem de Hitler tão extrema quanto temos hoje, embora ainda bem negativa por ser ditador.
Certamente não teria acontecido o holocausto, cerca de 6 milhões de judeus não teriam morrido. Provavelmente haveria uma grande colônia de judeus na Alemanha. Porém, isto não mudaria o fato da derrota e queda da Alemanha nazista.