Tem coisa que não é questão de preconceito. Se a crítica for baseada em conhecimento,

análise e ainda construtiva, acho válida.
Qualquer religião precisa ser criticada quando ela tenta ser externa (procurar por membros). Numa sociedade não questionadora das coisas "absolutas" a religião pode estragar as pessoas.
Sou contra o preconceito pra qualquer situação, mas não sou contra a crítica. Esta é sempre necessária.