Pura e simples tradição. Isso não é só pra médico, vale pra dentista, fisioterapeuta, veterinário

e argh, até advogado. Se bem que nesse último é por causa de um decreto do D. Pedro I que ao inaugurar as faculdades de ciências jurídicas no Brasil, tornou todos os formados aptos a serem chamados assim. Lembrando que doutor remete ao latim doctor e significa literalmente mestre, aquele que possui e passa o conhecimento. Em Portugal vale pra qualquer um com nível superior.

Enfim, se é tão importante pergunte, olhe o jaleco ou o diploma no consultório.