Depende da Universidade. Eu fiz um presencial na Estácio e agora estou fazendo outro totalmente

a distância, não vi diferença na qualidade de ensino. Aulas gravadas por bons professores, material didático com tudo que é abordado nas aulas, espaço para tirar dúvidas, etc
Gosto bastante e aprendo da mesma forma. Mas já iniciei um EAD em outra Universidade e detestei, método de ensino ruim, platarforma cavernosa, uma bosta. Qto ao mercado de trabalho, não vejo pq se preocupar, o diploma é o mesmo do presencial, não tem como saber que vc fez EAD e outra, hoje em dia não tem mais tanto preconceito, já vi várias empresas solicitando quem cursa Superior EAD, eles enxergam qualidades nessas pessoas, como responsabilidade, organização, entre outras.