Mulher é identidade de gênero (como a pessoa se sente internamente), que é diferente de

sexo atribuído no nascimento, que é diferente de expressão de gênero (que é como a pessoa escolhe se apresentar na sociedade).

Pra pessoas cis esses três geralmente se sobrepõem (foi atribuído um gênero e a pessoa se sente e se apresenta em conformidade), para pessoas trans, não. E esse desalinhamento por vezes causa disforia, uma condição que gera sofrimento para a pessoa.

Então, respondendo sua pergunta grosseira, mesmo que você provavelmente não esteja disposto a repensar o tópico, sim. Ser mulher (ou homem) não se relaciona a genitália.