É muito interessante essa sua pergunta, porque, apesar de "bonita" e "linda" serem usadas para

descrever algo agradável aos olhos, elas carregam nuances e intensidades diferentes.

Pense assim:

Bonita é um adjetivo mais geral, que descreve algo agradável, harmonioso, ou que tem uma beleza que se encaixa em padrões estéticos. Pode ser usado para pessoas, objetos, paisagens, e se refere a uma beleza mais "clássica" ou convencional.

Linda geralmente expressa uma beleza mais intensa, que emociona, que é excepcional ou extraordinária. É um adjetivo que transmite um sentimento de admiração mais forte.

Em resumo, o "linda" é como um superlativo do "bonita". Uma pessoa pode ser bonita e, em um momento específico, ou por uma característica especial, se tornar "linda" aos olhos de quem a vê.